Αύξηση μόλις 1,2% παρουσίασαν τα έσοδα του ΟΣΕ από επιβάτες για το 2006, γεγονός που σημαίνει ότι ελάχιστοι νέοι επιβάτες προτίμησαν τον σιδηρόδρομο για τις μετακινήσεις τους. Σύμφωνα με τον ισολογισμό του ΟΣΕ και των θυγατρικών του εταιρειών για το 2006 ο όμιλος αύξησε μόλις κατά 1,2% τα έσοδα από τη μεταφορά επιβατών, τα οποία το 2006 ανήλθαν σε 68,8 εκατ. ευρώ έναντι 67,9 εκατ. ευρώ το 2005. Εκτιμάται ότι το επιβατικό κοινό επηρεάστηκε σημαντικά από τα σιδηροδρομικά συμβάντα και ατυχήματα της τελευταίας διετίας, αλλά και από προβλήματα που προέρχονται από την πραγματοποίηση έργων που οδήγησαν στη ματαίωση και στη συγχώνευση δεκάδων δρομολογίων, με πρόσφατο παράδειγμα την ελαχιστοποίηση των δρομολογίων του Προαστιακού στον Πειραιά και του ΟΣΕ στη Χαλκίδα. Θετικό στοιχείο για τον ΟΣΕ είναι η αξιοσημείωτη άνοδος των εσόδων από τις εμπορευματικές μεταφορές, καθώς ο οργανισμός υλοποιεί κινήσεις για την αναβάθμιση της συγκεκριμένης υπηρεσίας. Τα έσοδα του ομίλου ΟΣΕ από τη μεταφορά εμπορευμάτων αυξήθηκαν από 12,9 εκατ. ευρώ το 2005 σε 27,4 εκατ. ευρώ το 2006, ενώ τα έσοδα από τη μεταφορά δεμάτων και αποσκευών από 1,3 εκατ. ευρώ το 2005 σε 1,5 εκατ. ευρώ πέρυσι. Ο κύκλος εργασιών σε ενοποιημένο επίπεδο διαμορφώθηκε στα 104,7 εκατ. ευρώ έναντι 94,8 εκατ. ευρώ το 2005, παρουσιάζοντας αύξηση κατά 10,41%. Αντίστοιχα, οι ζημιές μετά τους φόρους ανήλθαν πέρυσι στα 855,2 εκατ. ευρώ έναντι 840,2 εκατ. ευρώ το 2005, αυξημένες κατά 2%. Τέλος, η καθαρή θέση του ομίλου για το 2006 διαμορφώθηκε στα 5,1 δισ. ευρώ από 5,6 δισ. ευρώ το 2005, ενώ ο τραπεζικός δανεισμός μειώθηκε από τα 27,4 εκατ. ευρώ το 2005 σε 21,9 εκατ. ευρώ πέρυσι.