Διαστάσεις άρχισε να προσλαμβάνει η βεβήλωση ναών (ορθόδοξων και καθολικών) και μοναστηριών στα Κατεχόμενα, με αποτέλεσμα να παρέμβει η UΝΕSCΟ, αλλά και ο προκαθήμενος της Ρωμαιοκαθολικής Εκκλησίας Πάπας Βενέδικτος ΙΣτ Δ . Βυζαντινές εκκλησίες έχουν μετατραπεί σε νυχτερινά κέντρα, καφετέριες, πιτσαρίες, αποθήκες, ακόμη και σε στάβλους, ενώ τούρκοι τουριστικοί επιχειρηματίες, με την ανοχή του κατοχικού καθεστώτος, τοποθέτησαν φωτορρυθμικά και πολύχρωμα φώτα που αναβοσβήνουν σε ρυθμούς τραγουδιών της Μαντόνα και της Lady Gaga σε μεσαιωνικές τοιχογραφίες. Στο Μετόχι του Κύκκου, στις ελεύθερες περιοχές, δόθηκε συνέντευξη Τύπου όπου παρουσιάστηκαν νέα στοιχεία τα οποία καταδεικνύουν το μέγεθος της καταστροφής. Για κάποιες περιπτώσεις, σύμφωνα με τον καθηγητή κ. Χαρ.Χοτζάκογλου, διευθυντή του προγράμματος καταγραφής των θρησκευτικών μνημείων στα Κατεχόμενα, ευθύνονται και οι Ελληνοκύπριοι, καθώς δεν ήταν όσο διεκδικητικοί έπρεπε για την προστασία των μνημείων.
Οι καταστροφές και οι βεβηλώσεις προκάλεσαν την αντίδραση του Πάπα, ο οποίος θα επισκεφθεί την Κύπρο τον προσεχή Ιούνιο έχοντας στα χέρια του ειδικό βιβλίο με φωτογραφίες από τους χριστιανικούς ναούς που έχουν μετατραπεί σε στάβλους και αποθήκες, το οποίο του έδωσε προσωπικά ο κύπριος πρόεδρος κ. Δ. Χριστόφιας.
Τη Ρωμαιοκαθολική Εκκλησία ενδιαφέρει πρωτίστως η περίπτωση του γοτθικού ναού του Αγίου Φραγκίσκου στην Αμμόχωστο, ο οποίος έχει μετατραπεί σε μπιραρία-πιτσαρία, ενώ ένας άλλος ναός, εκείνος των Ιωαννιτών Ιπποτών, έχει μετατραπεί σε νυχτερινό κέντρο με φωτορυθμικά και στο Ιερό Βήμα του έχει… εγκατασταθεί ένα ροκ συγκρότημα. Τον ναό επισκέπτονται χιλιάδες τουρίστες από τη Γερμανία και την Αγγλία, χωρίς να τους ενοχλεί το γεγονός ότι ακούν Μαντόνα μέσα σε μεσαιωνικό χριστιανικό ναό.
Την ίδια ώρα φαίνεται να αυξάνονται και οι περιπτώσεις λαθρανασκαφών εντός των ιερών ναών στο τουρκοκρατούμενο τμήμα της Κύπρου. Χαρακτηριστικό παράδειγμα ο ναός της Παναγίας Τραπέζης στην Αχερίτου. Το δάπεδο, όπου υπήρχαν μεσαιωνικές ταφές, βρέθηκε σκαμμένο και στα διανοιχθέντα ορύγματα εντοπίστηκαν θραύσματα από μεσαιωνικά αγγεία. Σε έναν άλλον βυζαντινό ναό, του Οσίου Ευφημιανού, στην κατεχόμενη Λύση, το πάτωμα βρέθηκε λεηλατημένο, ενώ έλειπαν οι τοιχογραφίες του τρούλου και του τεταρτοσφαιρίου της αψίδας. Επίσης ο ναός της Παναγίας του Τράχωνα έχει μετατραπεί σε χοροδιδασκαλείο, ενώ σύμφωνα με τις κυπριακές εφημερίδες «Σημερινή» και «Αλήθεια» ένα ιστορικό μοναστήρι, αυτό της Αγίας Αναστασίας στην κατεχόμενη Λάπηθο, έχει μετατραπεί σε ξενοδοχείο, το… Αnastasia Resort Ηotel, με πισίνα και καζίνο.