Με το φορολογικό νομοσχέδιο καταργούνται διατάξεις δεκαετιών που αφορούν τους βουλευτές και τους δικαστικούς. Οπως αναφέρεται χαρακτηριστικά στην αιτιολογική έκθεση του νομοσχεδίου, «καταργείται ο ειδικός τρόπος φορολόγησης των αποζημιώσεων βουλευτών-δικαστών, καθόσον αποτελεί παρέκκλιση από τον κανόνα της φορολογικής ισότητας». Αυτό ουσιαστικά σημαίνει ότι όλα τα εισοδήματα των βουλευτών και των δικαστικών, απ΄ όπου και αν αυτά προέρχονται, θα φορολογούνται με βάση τη φορολογική κλίμακα και όχι αυτοτελώς. Παράλληλα, καταργείται ο ειδικός τρόπος φορολόγησης των αμοιβών που εισπράττουν οι συνεργάτες των ευρωβουλευτών, καθ΄ όσον αποτελεί παρέκκλιση από τον κανόνα της φορολογικής ισότητας.
Η επίμαχη διάταξη για τους βουλευτές και τους δικαστές «Οι διατάξεις του άρθρου 5 εκτός των δύο τελευταίων εδαφίων της παραγράφου 1 του Ζ΄ ψηφίσματος του έτους 1975 (ΦΕΚ Α΄ 23) της Ε΄ Αναθεωρητικής Βουλής, όπως αυτές αντικαταστάθηκαν με τις παραγράφους 1 έως 5 του άρθρου 10 του Ν. 2459/1997, καταργούνται».