«Εμφύλιος πόλεμος» ξέσπασε στην Ιεραρχία της Εκκλησίας της Ελλάδος μετά τη φορολόγηση 20% των εσόδων που προέρχονται από την εκκλησιαστική περιουσία. Αφορμή για το ξέσπασμα του πολέμου αποτέλεσαν οι ανακοινώσεις των Μητροπολιτών Μεσογαίας κ. Νικολάου και Αλεξανδρουπόλεως κ. Ανθιμου οι οποίοι δήλωσαν ότι προσφέρουν τον μισθό τους στο κράτος για την αντιμετώπιση της οικονομικής κρίσης από την οποία πλήττεται η χώρα. Η απάντηση της άλλης πλευράς ήλθε διά του γενικού διευθυντή της Κεντρικής Οικονομικής Υπηρεσίας της Εκκλησίας (ΕΚΥΟ) κ. Αντώνη Ζαμπέλη , ο οποίος από τη συχνότητα του ραδιοφωνικού σταθμού της Εκκλησίας χαρακτήρισε τις δηλώσεις των ιεραρχών «ακραίο φαινόμενο λαϊκισμού ». Μάλιστα στη συνέχεια διερωτήθηκε με δηκτικό τρόπο: «Πώς θα ζήσουν χωρίς μισθό, θα τους ζήσει η Εκκλησία;» .

Ο κ. Ζαμπέλης αντιτάχθηκε και στις απόψεις όλων όσοι προτρέπουν την Εκκλησία να παραχωρήσει τις μετοχές που διαθέτει στην Εθνική Τράπεζα στο κράτος, λέγοντας ότι μια τέτοια κίνηση θα οδηγήσει σε οικονομική ασφυξία την Εκκλησία. Τις θέσεις του γενικού διευθυντή της ΕΚΥΟ υιοθέτησαν και ιεράρχες οι οποίοι με δηλώσεις τους επισήμαιναν ότι με τις θέσεις που εξέφρασαν οι μητροπολίτες Αλεξανδρουπόλεως και Μεσογαίας χωρίζουν την Ιεραρχία «σε καλούς και κακούς». Ακόμη ζητούν την έκτακτη σύγκληση της Συνόδου της Ιεραρχίας προκειμένου να ληφθούν άμεσες αποφάσεις για τον τρόπο αντίδρασης της Εκκλησίας. Την ίδια ώρα που στο Συνοδικό Μέγαρο της Μονής Πετράκη έφθαναν οι διαμαρτυρίες μητροπολιτών για τη φορολόγηση στα ακαθάριστα έσοδα της Εκκλησίας, ο Αρχιεπίσκοπος κ. Ιερώνυμος βρισκόταν στο Προεδρικό Μέγαρο και σε συνομιλίες που είχε με γνωστούς συνεργάτες του Πρωθυπουργού, όπως ο κ. Χ. Παμπούκης , εξέφραζε τον έντονο προβληματισμό του για τις αποφάσεις της κυβέρνησης. «Δεν μπορείτε να μας φορολογείτε επί των ακαθαρίστων εσόδων» δήλωνε ο Αρχιεπίσκοπος. Και όπως τόνιζε σε όλους τους συνομιλητές του «η Ιεραρχία έχει τη διάθεση να καταβάλει φόρους όπως πράττει επί χρόνια αλλά δεν μπορεί να αντεπεξέλθει σε μια τέτοιου είδους φορολόγηση. Θα πρέπει τουλάχιστον η φορολόγηση να πραγματοποιείται επί των καθαρών εσόδων που προκύπτουν από τα ακίνητα της Εκκλησίας».

Αξίζει να σημειωθεί ότι τα τελευταία εικοσιτετράωρα ο Αρχιεπίσκοπος δέχεται τα φίλια πυρά πολλών μητροπολιτών οι οποίοι θεωρούν ότι ακολουθεί ενδοτική πολιτική έναντι της κυβέρνησης.