Τη διαφωνία του με την απόφαση του υπουργού Προστασίας του Πολίτη Μιχάλη Χρυσοχοΐδη να αποσύρει από το νομοσχέδιο το άρθρο που έδινε τη δυνατότητα στο Λιμενικό Σώμα-Ελληνική Ακτοφυλακή να μετέχει στην προφύλαξη εμπορικών πλοίων από τη ναυτική πειρατεία, διατύπωσε ο προκάτοχος του Χρ. Παπουτσής.
«Η δυνατότητα για τη συμμετοχή των ειδικών δυνάμεων του Λιμενικού Σώματος-Ελληνικής Ακτοφυλακής στη φύλαξη των πλοίων προβλέφθηκε προκειμένου να έχει και το ελληνικό δημόσιο μια θέση στην αγορά που δημιουργούμε» είπε ο κ. Παπουτσής, προσθέτοντας:
«Επί χρόνια λέμε ότι το δημόσιο δεν είναι ευέλικτο και δεν φέρνει έσοδα. Ομως το Λιμενικό είναι εκπαιδευμένο, με εκπαίδευση για την οποία μάλιστα ο ελληνικός λαός έχει ξοδέψει αρκετά χρήματα, και δεν υπάρχει κανένας λόγος να αποκλειστεί το λιμενικό από την αγορά αυτή και αν συμμετείχε θα έθετε πολύ ψηλά τον πήχη».
Ο ίδιος υπογράμμισε ότι το νομοσχέδιο και η συγκεκριμένη διάταξη είχε την έγκριση του υπουργικού συμβουλίου και της αρμόδιας κοινοβουλευτικής επιτροπής, ωστόσο παραδέχθηκε ότι στη συνεδρίαση του υπουργικού συμβουλίου, ο κ. Χρυσοχοΐδης είχε διαφοροποιηθεί από το συγκεκριμένο άρθρο και αναγνώρισε ότι την τελική ευθύνη την έχει ο σημερινός υπουργός και η κυβέρνηση.
Ο κ. Παπουτσής αναφέρθηκε επίσης και στην ανάγκη δημιουργίας αυτόνομου υπουργείου Εμπορικής Ναυτιλίας, υπογράμμισε όμως ότι το Λιμενικό Σώμα-Ελληνική Ακτοφυλακή δεν πρέπει να υπαχθεί κάτω από το εφοπλιστικό κεφάλαιο, πολύ περισσότερο σε μια περίοδο που στην Ευρώπη συζητείται η Ευρωπαϊκή Ακτοφυλακή.